本发明涉及一种甜叶菊种子脱毛机及其处理脱毛的方法。X先带毛甜叶菊种子由送料口送进碰撞脱毛箱,碰撞箱内,主动轴上的旋转的铁齿和钭齿带动甜叶菊种子做圆周运动,并与固定在箱体上的铁齿进行碰撞,甜叶菊部分种子开始脱毛;然后,经过揉搓箱内从动轴上旋转的毛刷和固定的萝子网形成相对运动,搓掉种子上的毛,再通过揉搓箱底部斜送料口进入送风圆柱管内的脱过毛的种子和脱掉的毛、蔫秕秕的种子混合物,经分选,轻的毛和蔫蓖蓖的种子吹出壳外,脱过毛的甜叶菊种子落托盘里。本发明替代目前的甜叶菊种子脱毛用手工揉搓脱毛。解决了人工揉搓脱毛工序烦琐,用人工量大,效率低的问题,为发展大田甜叶菊种植提供脱毛甜叶菊种子。